| تعداد نشریات | 285 |
| تعداد نشریات سازمان | 83 |
| تعداد شمارهها | 3,110 |
| تعداد مقالات | 34,666 |
| تعداد مشاهده مقاله | 49,822,710 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 80,169,552 |
Sequence Analysis and Phylogenetic Profiling of the Nonstructural (NS) Genes of H9N2 Influenza A Viruses Isolated in Iran during 1998-2007 | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| مقاله 2، دوره 69، شماره 2، اسفند 2014، صفحه 127-135 اصل مقاله (571.64 K) | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.7508/ari.2014.02.002 | ||
| نویسندگان | ||
| M. Ebrahimi؛ S. Grigorian؛ A. Shoushtari* ؛ F. Abedini؛ H. Moeini | ||
| چکیده | ||
| The earliest evidences on circulation of Avian Influenza (AI) virus on the Iranian poultry farms date back to 1998. Great economic losses through dramatic drop in egg production and high mortality rates are characteristically attributed to H9N2 AI virus. In the present work non-structural (NS) genes of 10 Iranian H9N2 chicken AI viruses collected during 1998-2007 were fully sequenced and subjected to a phylogenetic analysis. The observations proved allele A was the single-detectable type of the NS gene within the studied isolates. All the examined Iranian isolates fell into the Korean sublineage with a relatively broad sequence homology (91.6-98%) in nucleotide construction of the NS genes. The motif for PDZ ligand recognition of the group one isolates was either EDEV (N=6) or ESEV (N=1) While all viruses as group two contained a PL motif “KSEV” (N=3). The present work provides useful epidemiological data at molecular level on source and contemporary evolution of H9N2 virus population in Iran. | ||
| کلیدواژهها | ||
| Phylogenetic profiling؛ influenza virus؛ H9N2؛ NS gene | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| بررسی توالی ژنی و درخت فیلوژنتیک ژن Nonstructural (NS) ویروس های آنفلوانزای سویه H9N2 جدا شده در ایران طی سالهای 1386-1377 | ||
| نویسندگان [English] | ||
| محمد ابراهیمی؛ سورن گریگوریان؛ عبدالحمید شوشتری؛ فاطمه عابدینی؛ حسن موئینی | ||
| چکیده [English] | ||
| اولین گزارش شیوع ویروس آنفلوآنزادر گله های طیور ایران مربوط به سال 1998 می باشد. درصد مرگ و میر بالا و کاهش شدید تولید تخم مرغ از عوارض اقتصادی است که به ویروس آنفلوآنزا سویه H9N2 نسبت داده می شود. در مطالعه حاضر ژن NS ده نمونه ویروس آنفلوانزا طیور سویه H9N2 که طی سال های 1386-1377 از استانهای مختلف ایران جدا شده بودند بطور کامل از نظر توالی اسیدهای آمینه و نوکلئیک وفیلوژنی مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. نتایج نشان داد که تمام این ویروسها متعلق به آلل A هستند و تحت تیپ ویروس کره ای A/Chicken/Korea/38349-p96323/96 به دو گروه مجزا تقسیم می شوند. میزان همولوژی ژن NS در بین نمونه های مورد مطالعه از 7/98-6/91 درصد متغیر بوده است. موتیف شناساگر لیگاند PDZ در ویروسهای گروه اول این مطالعه EDEV (N=6) و یا (N=1) ESEV بود در حالیکه موتیف شناساگر لیگاند PDZ ویروسهای گروه دوم KSEV (N=3) بود. مطالعه حاضر اطلاعات مولکولار اپیدمیولوژیک بسیار مفیدی در رابطه با مسیر تکاملی و منشا ویروسهای آنفلوآنزا که در طی سالهای 1377 تا 1386 در مرغداریهای ایران در گردش بودند را در اختیار ما قرار می دهد. | ||
| کلیدواژهها [English] | ||
| فیلوژنتیک پروفایلینگ, ویروس آنفلونزا, H9N2, ژنNS, ایران | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 13,433 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 55,683 |
||