| تعداد نشریات | 286 |
| تعداد نشریات سازمان | 84 |
| تعداد شماره‌ها | 2,944 |
| تعداد مقالات | 33,229 |
| تعداد مشاهده مقاله | 43,870,741 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 20,378,108 |
S1 gene sequence analysis of infectious bronchitis virus vaccinal strains (H120 & H52) and their embryo-passaged derivatives | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| مقاله 3، دوره 71، شماره 2، شهریور 2016، صفحه 87-96 اصل مقاله (667.29 K) | ||
| نوع مقاله: Original Articles | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22034/ari.2016.106446 | ||
| نویسندگان | ||
| M. Bakhshesh* ؛ S. Masoudi؛ M. Esmailizad؛ B. Khalesi | ||
| Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran | ||
| چکیده | ||
| Avian infectious bronchitis is an acute and highly contagious disease that mainly causes respiratory symptoms in poultry. A number of serotypes and variants of the viral agent with poor cross-protection are the major problem to achieve desired immunity from vaccination. The S1 subunit of S glycoprotein (spike) is the major determinant of IBV so that a minor change in amino acid sequence of this protein, alters the virus strain. Therefore, characterization of the sequence of S1 gene is necessary to identify virus strains and their similarities with the vaccinal strains. In this research, the S1 sequence of H52 and H120 vaccinal strains of Razi Institute was fully characterized, and also the effect of serial passages in embryonated - eggs (5 passages beyond the master seed) on the S1 gene was investigated. The results showed that H120 and H52 strains of Razi Institute are 100% identical to the reference vaccine strains available in the GenBank. In addition, the H52 strain showed one amino acid substitution from the 3rd passage in which Glycine (G) was replaced by Valine (V) at position 118 making these passages exactly identical to the H120 strain while no change occurred for the H120 strain during these passages. Analysis of the original vaccinal strains which are widely administered in Iran, is definitely useful for prevention and control strategies against the circulating viruses. To identify the genetic change(s) responsible for attenuation of these strains during passages in embryonated-egg, characterization of other genes, especially those involved in replication is recommended. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| IBV؛ Vaccinal strain؛ S1 gene characterization؛ egg- passaged | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| آنالیز توالی ژن S1 سویه های واکسینال برونشیت عفونی طیور(H120 & H52) و ارزیابی تاثیر پاساژهای متوالی در تخم مرغ جنین دار بر آنها | ||
| نویسندگان [English] | ||
| مهران بخشش؛ شهین مسعودی؛ مجید اسمعیلی‌زاد؛ بهمن خالصی | ||
| موسسه تحقیقات واکسن و سرم سازی رازی، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران | ||
| چکیده [English] | ||
| بیماری برونشیت عفونی طیور(IB) یکی از بیماریهای حاد و بشدت واگیردار طیور است که عمدتاً موجب ابتلاء دستگاه تنفس میشود. وجود تعداد زیاد سویه‌ها و سروتیپهای ویروس عامل بیماری که قادر به ایجاد ایمنیت متقاطع بر علیه یکدیگر نیستند مهمترین مانع کسب نتایج مطلوب از واکسیناسیون میباشد. پروتئین S1 تحت واحد گلیکو پروتیینی S یا Spike این ویروس نقش اصلی را در تعیین سروتیپهای ویروس و تحریک سیستم ایمنی و اتصال ویروس به سلولهای میزبان را به عهده دارد. تغییرات جزئی در توالی اسیدهای آمینه این پروتئین موجب تغییر سویه ویروس و فقدان ایمنیت متقاطع میشود. به همین علت تعیین توالی ژن کد کننده پروتئین S1 از اهمیت بالایی برخورداراست و در تعیین سویه‌های ویروس و میزان قرابت آنها با واکسنهای مورد استفاده قرار می‌گیرد. در این بررسی ژن S1 سویه های واکسینال H120 و H52 به صورت کامل توالی یابی شد و سپس تاثیر پاساژهای متوالی (5 پاساژ بعد از بذر مادر) در تخم مرغ جنین دار SPF بر این سویه‌ها مورد ارزیابی قرارگرفت. نتایج این مطالعه مشخص نمود که اولاً سویه‌های H120 و H52 تولید شده در مؤسسه رازی منطبق بر سویه‌های رفرانس ثبت شده در بانک ژن هستند. ثانیاً سویه H52 از پاساژ سوم به بعد دارای تغییر اسید آمینه گلایسین (G) به والین (V) در موقعیت 118 میباشد که موجب قرابت 100% پاساژهای سوم به بعد آن به سویه H120 شده است، در حالی که پاساژهای 1 تا 5 سویه H120 موجب تغییر این سویه نشده است. به منظور تعیین عامل تخفیف حدت این سویه‌ها در پاساژهای متوالی در تخم مرغ آنالیز سایر ژنها به ویژه ژنهای مسئول تکثیر ویروس در مطالعات بعدی توصیه میشود. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| IBV, Vaccinal strain, S1 gene characterization, egg- passaged | ||
| مراجع | ||
|
Ammayappan, A., Upadhyay, C., Gelb, J., Jr., Vakharia, V.N., 2009. Identification of sequence changes responsible for the attenuation of avian infectious bronchitis virus strain Arkansas DPI. Archives of virology 154, 495-499. Bijlenga, G., Cook, J.K., Gelb, J., Jr., de Wit, J.J., 2004. Development and use of the H strain of avian infectious bronchitis virus from the Netherlands as a vaccine: a review. Avian pathology : journal of the W.V.P.A 33, 550-557. Capua, I., Minta, Z., Karpinska, E., Mawditt, K., Britton, P., Cavanagh, D., Gough, R.E., 1999. Co-circulation of four types of infectious bronchitis virus (793/B, 624/I, B1648 and Massachusetts). Avian Pathology 28, 587-592. Cavanagh, D., 1981. Structural polypeptides of coronavirus IBV. The Journal of general virology 53, 93-103. Cavanagh, D., 2007. Coronavirus avian infectious bronchitis virus. Veterinary research 38, 281-297. Cavanagh, D., Davis, P.J., Cook, J.K., Li, D., Kant, A., Koch, G., 1992. Location of the amino acid differences in the S1 spike glycoprotein subunit of closely related serotypes of infectious bronchitis virus. Avian pathology : journal of the W.V.P.A 21, 33-43. Cavanagh, D., Davis, P.J., Mockett, A.P.A., 1988. Amino acids within hypervariable region 1 of avian coronavirus IBV (Massachusetts serotype) spike glycoprotein are associated with neutralization epitopes. Virus Research 11, 141-150. Cavanagh, D., Picault, J.P., Gough, R., Hess, M., Mawditt, K., Britton, P., 2005. Variation in the spike protein of the 793/B type of infectious bronchitis virus, in the field and during alternate passage in chickens and embryonated eggs. Avian pathology : journal of the W.V.P.A 34, 20-25. Jackwood, M.W., Boynton, T.O., Hilt, D.A., McKinley, E.T., Kissinger, J.C., Paterson, A.H., Robertson, J., Lemke, C., McCall, A.W., Williams, S.M., Jackwood, J.W., Byrd, L.A., 2010. Emergence of a group 3 coronavirus through recombination. Virology 398, 98-108. Jackwood, M.W., Hall, D., Handel, A., 2012. Molecular evolution and emergence of avian gammacoronaviruses. Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases 12, 1305-1311. Kant, A., Koch, G., van Roozelaar, D.J., Kusters, J.G., Poelwijk, F.A., van der Zeijst, B.A., 1992. Location of antigenic sites defined by neutralizing monoclonal antibodies on the S1 avian infectious bronchitis virus glycopolypeptide. The Journal of general virology 73 ( Pt 3), 591-596. Koch, G., Hartog, L., Kant, A., van Roozelaar, D.J., 1990. Antigenic domains on the peplomer protein of avian infectious bronchitis virus: correlation with biological functions. The Journal of general virology 71 ( Pt 9), 1929-1935. Lee, C.-W., Jackwood, M.W., 2001. Origin and evolution of Georgia 98 (GA98), a new serotype of avian infectious bronchitis virus. Virus Research 80, 33-39. Masters, P., Perlman, S., 2013. Coronaviridae in Fields of virology, Lippincot Williams& Wilkins, Philadelphia, USA.
McKinley, E.T., Hilt, D.A., Jackwood, M.W., 2008. Avian coronavirus infectious bronchitis attenuated live vaccines undergo selection of subpopulations and mutations following vaccination. Vaccine 26, 1274-1284. Phillips, J.E., Jackwood, M.W., McKinley, E.T., Thor, S.W., Hilt, D.A., Acevedol, N.D., Williams, S.M., Kissinger, J.C., Paterson, A.H., Robertson, J.S., Lemke, C., 2012. Changes in nonstructural protein 3 are associated with attenuation in avian coronavirus infectious bronchitis virus. Virus genes 44, 63-74. Sutou, S., Sato, S., Okabe, T., Nakai, M., Sasaki, N., 1988. Cloning and sequencing of genes encoding structural proteins of avian infectious bronchitis virus. Virology 165, 589-595. Thompson, J.D., Higgins, D.G., Gibson, T.J., 1994. CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice. Nucleic acids research 22, 4673-4680. Thor, S.W., Hilt, D.A., Kissinger, J.C., Paterson, A.H., Jackwood, M.W., 2011. Recombination in avian gamma-coronavirus infectious bronchitis virus. Viruses 3, 1777-1799. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 2,629 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 2,077 |
||