| تعداد نشریات | 286 |
| تعداد نشریات سازمان | 84 |
| تعداد شماره‌ها | 2,944 |
| تعداد مقالات | 33,229 |
| تعداد مشاهده مقاله | 43,865,132 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 20,370,884 |
جداسازی آنالوگ‌های ژن‌های مقاومت به بیماری(RGAs) در سیب‌زمینی با استفاده از روش | ||
| نهال و بذر | ||
| مقاله 7، دوره 26، شماره 1، اردیبهشت 1389، صفحه 105-123 اصل مقاله (615.71 K) | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/spij.2017.110972 | ||
| نویسندگان | ||
| سید ابوالقاسم محمدی؛ محمد مقدم؛ سعید اهری‌زاد؛ ژاک اچ. وسن؛ | ||
| چکیده | ||
| استفاده از ارقام مقاوم یکی از راه‌کارهای اصلی کاهش خسارت ناشی از تنش‌های زیستی در گیاهان است. لازمه تولید چنین ارقامی شناسایی، جداسازی و مکان‌یابی ژن‌های مقاومت به بیماری است. در این پژوهش، برای جداسازی آنالوگ‌های ژن‌های مقاومت به بیماری در سیب‌زمینی از روش Motif directed Profiling (MdP) استفاده شد. بدین منظور، هفت آغازگر دژنره طراحی شده براساس دامنه حفاظت‌شده TIR ژن‌های مقاومت به بیماری گیاهی برای تکثیر آنالوگ‌های ژن‌های مقاومت به بیماری در 46 نتاج F1 حاصل از تلاقی دو والد دیپلویید هتروزیگوت SH83-92-488(SH) و RH89-039-16(RH) با حداکثر نوترکیبی مورداستفاده قرار گرفت. در مجموع 454 نشانگر چندشکل حاصل شد که با استفاده از نقشه پیوستگی AFLP جمعیت متشکل از 10000 نشانگر، مکان‌یابی شدند. برای شناسایی RGAها تعدادی از نوارها جداسازی و توالی‌یابی شدند که 11/66 درصد آن‌ها (160 نوار) تشابه معنی‌دار با ژن‌های مقاومت شناخته‌شده و RGAها داشتند و اغلب این RGAها در نواحی ژنومی سیب‌زمینی و گوجه‌فرنگی دارای خوشه‌های RGA مکان‌یابی شدند. نقشه پیوستگی این RGAها در ارتباط با نقشه پیوستگی فوق‌اشباع این جمعیت با 10000 نشانگر AFLP نشان داد که اغلب این RGAها در خوشه‌ها یا زیرخوشه‌های جدید یا موجود در نقشه گروه‌بندی شدند. تعداد 117 نشانگر در مکان‌های منطبق با خوشه‌های ژن‌های مقاومت روی کروموزوم‌های 5، 6، 9 و 11 و همچنین 15 نشانگر در جایگاه تقریبی مکان‌های ژنی کمّی مقاومت موجود در کروموزوم‌های 1، 2، 4 و 7 مکان‌یابی شدند. اکثریت این RGAها، معرف توالی‌های RGA جدید بودند. نتایج حاصل از این پژوهش می‌تواند در مکان‌یابی ژن‌های مقاومت منفرد و مکان‌های کمی مقاومت به بیماری‌ها مورداستفاده قرار گیرد | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| سیب‌زمینی؛ آنالوگ‌های ژن‌های مقاومت به بیماری(RGAs)؛ .Motif directed Profiling | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Isolation of Resistance Gene Analogues (RGAs) in Potato Using Motif directed Profiling Method and Development of Their Genetic Map | ||
| نویسندگان [English] | ||
| S. A. Mohammadi؛ M. Moghaddam؛ S. Aharizah؛ J. H. Vossen؛ | ||
| چکیده [English] | ||
| Use of resistance cultivars is one of the major approaches to reduce crop damages caused by biotic stresses. Development of such cultivars requires identification, isolation and mapping of resistance genes. In this research, motif directed profiling (MdP) method was used to isolate resistance gene analogues (RGAs) in potato. For this purpose, seven degenerate primers designed based on conserved TIR domain of plant disease resistance genes were used to amplify RGAs in 46 F1 progeny derived from a cross between the diploid heterozygous parents SH83-92-488(SH) and RH89-039-16(RH) with highest recombination. In total, 454 polymorphic markers were produced that were mapped relative to SH×RH linkage map consisted of 10,000 AFLP markers. To identify RGAs, some of the bands were isolated and sequenced and out of which 66.11% (160 bands) represented significant similarity with known resistance genes and RGAs and most of them were mapped in chromosomal regions of potato or tomato having RGA clusters. Linkage map of these RGAs in relation to ultra dense (UHD) genetic map of the population, consisted of 10,000 AFLP markers, showed that most of the RGAs were organized in new or existed clusters or sub-clusters on the map. One hundred and seventeen markers were mapped in the positions corresponding to the resistance gene clusters on chromosomes 5, 6, 9 and 11 and 15 markers were mapped in approximate positions of quantitative resistance loci on chromosomes 1, 2, 4 and 7. The majority of these RGAs represent novel RGA sequences. The results of this research could be used in mapping of single resistance genes and quantitative resistance loci. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Potato, Motif directed Profiling, resistance gene analogues | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 245 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 247 |
||