- همه نشریات
- نشریات علمی سازمان تحقیقات، آموزش و ترویچ کشاورزی
- مجلات ترویجی سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
- سایر نشریات سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
- نشریات علمی انجمن ها
- علوم آب و خاک
- علوم اقتصاد و ترویج کشاورزی
- علوم جنگل, مرتع و آبخیزداری
- علوم دامی و شیلات
- علوم زراعی و باغی
- علوم گیاهپزشکی
- علوم مهندسی و مکانیزاسیون کشاورزی
- نشریات با زبان انگلیسی
- نشریات با زبان فارسی
- نشریات دانشگاه آزاد اسلامی
- نشریات علمی
پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 283 |
| تعداد نشریات سازمان | 81 |
| تعداد شماره‌ها | 2,726 |
| تعداد مقالات | 31,041 |
| تعداد مشاهده مقاله | 27,752,333 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 16,222,556 |
Proteome Analysis of Toxic Fractions of Iranian Cobra (Naja naja Oxiana) Snake Venom Using Two-Dimensional Electrophoresis and Mass Spectrometry | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| مقاله 16، دوره 76، شماره 1، خرداد 2021، صفحه 127-138 اصل مقاله (405.11 K) | ||
| نوع مقاله: Original Articles | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ari.2020.128766.1428 | ||
| نویسندگان | ||
| M Samianifard1؛ A Nazari* 1؛ F Tahoori2؛ N Mohamadpour Dounighi3 | ||
| 1Department of Proteomics-Biochemistry, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran | ||
| 2Department of Human Bacterial Vaccine, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iranand Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran | ||
| 3Department of Venomous Animal, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran | ||
| چکیده | ||
| Snake venoms are mostly composed of various proteins and peptides with toxicity and pharmacological effects depending on their geographical sources. Naja naja oxiana is one of the most medically important venomous snakes in Iran and Central Asia. The bite of this type of snake can cause severe pain and swelling, as well as neurotoxicity. Without medical treatment, symptoms quickly worsen and death can occur soon. A detailed understanding of venom components can provide new insight into the production of antivenom against toxic agents instead of crude venom. Specific antibodies against toxic fractions are of utmost importance in neutralizing crude venom. Therefore, the proteome profile of these fractions of Naja naja oxidana venom was analyzed using fractionation by gel filtration, two-dimensional electrophoresis, mass spectrometry, and data mining. Base on the results, in total, 32 spots were detected and categorized into three protein families, namely three-finger toxin (3FTx), phospholipase, and Cysteine-rich secretory proteins (CRISP). These proteins consist of more than 70% crude venom all with a molecular weight below 25 kDa. The 3FTx as a highly diverse constituent in the venom of Naja species was in large quantity in this district. Short-chain neurotoxins, including short neurotoxin, cytotoxin, and muscarinic toxin-like protein, were in abundance, respectively. In conclusion, the recognition of toxic fractions of Naja naja oxiana in this region could be of great help in the production of an effective antivenom against similar compositions. It can also help the medical care department to find out the clinical sign of cobra venom. To the best of our knowledge, this was the first study to report the proteomic of toxic fractions of Naja naja oxiana in Iran. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| Venom proteome؛ 2D gel Electrophoresis؛ Mass spectrometry؛ Naja naja oxiana؛ Chromatography | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| آنالیز پروتئوم فراکسیون های سمی مار کبرای ایرانی به وسیله الکتروفورز دوبعدی و طیف سنجی جرمی | ||
| چکیده [English] | ||
| زهر مارها با توجه به منشاء جغرافیایی شامل پروتئینها و پپتیدهایی با خاصیت توکسیک و دارویی میباشند. مار کبری یا ناجا اکسیانا یکی از مارهای زهری مهم در حوزه پزشکی میباشد که در ایران و آسیای مرکزی میباشد. مار گزیدگی در این مورد میتواند باعث صدمه و تورم بافت مورد نظر بهمراه اثرات توکسیک گردد. چنانچه درمانی در این راستا انجام نگردد علائم سریعا پیشرفت کرده و نهایتا مرگ به همراه دارد. شناخت دقیق اجزای تشکیل دهنده زهر بینش جدیدی در تهیه آنتی ونوم بر علیه اجزای موثر زهر بجای زهر خام خواهد گشود. بدلیل اهمیت اجزای توکسیک زهر در فرایند خنثی سازی زهر خام توسط آنتی ونوم، پروفایل پروتئینی اجزای سمی زهر مار کبری با استفاده از کروماتوگرافی ژل فیلتراسیون، التروفورز دوبعدی و طیف سنجی جرمی انجام گردید.نتایج حاصل از مطالعه بر روی 32 نمونه بدست آمده از الکتروفورز دو بعدی با توجه به دیتا بیسهای حاوی اطلاعات پروتئومیکس مشخص گردید که بیش از هفتاد درصد زهر خام مار کبری اجزای توکسیک میباشند متشکل از سه خانواده پروتئینی توکسینهای 3FTx ،آنزیم فسفولیپاز و پروتئینهای غنی از سیستئین که جملگی وزن ملکولی کمتر از 25 کیلودالتون دارند. توکسینهای خانواده 3FTx اجزای با ساختار متغیرو به میزان بالا از زهر خانواده مار کبری در منطقه ایران هستند. نوروتوکسینهای کوتاه، سیتوتوکسنها و موسکارینیک توکسین به ترتیب در زهر مار کبری بیشترین مقدار را دارند. بررسی پروفایل ایمنی زهر مار کبری در فضای دوبعدی مشخص نمود که اجزای ایمنوژن زهر مار کبری عمتا اجزای توکسیک میباشند. بطور خلاصه مشخص شدن جزئیات و مشخصات پروتئینی اجزای توکسیک زهر مار کبری از ایران میتواند در جهت تهیه آنتی ونوم موثرتر باشد در عین حالی که در شناخت علائم کلینیک حاصل از گزیدگی توسط مار کبری با توجه به گزارشات قبلی احتمال بررسی بهتر دارد. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| پروتئومیکس زهرمار, الکتروفورز دوبعدی, طیف سنجی جرمی, مار کبری ایرانی, کروماتوگرافی | ||
|
سایر فایل های مرتبط با مقاله
|
||
| مراجع | ||
|
Akbari, A., Rabiei, H., Hedayat, A., Mohammadpour, N., Zolfagharian, H., Teimorzadeh, S.J.a.o.r.i., 2010. Production of effective antivenin to treat cobra snake (Naja naja oxiana) envenoming. Arch Razi Inst 65, 33-37.
Binh, D., Thanh, T., Chi, P., 2010. Proteomic characterization of the thermostable toxins from Naja naja venom. J Venom Anim Toxins incl Trop Dis 16, 631-638.
Calvete, J.J., Sanz, L., Angulo, Y., Lomonte, B., Gutierrez, J.M., 2009. Venoms, venomics, antivenomics. FEBS Lett 583, 1736-1743.
Dehghani, R., Fathi, B., Shahi, M.P., Jazayeri, M., 2014. Ten years of snakebites in Iran. Toxicon 90, 291-298.
Dubovskii, P.V., Lesovoy, D.M., Dubinnyi, M.A., Konshina, A.G., Utkin, Y.N., Efremov, R.G., et al., 2005. Interaction of three-finger toxins with phospholipid membranes: comparison of S- and P-type cytotoxins. Biochem J 387, 807-815.
Dutta, S., Chanda, A., Kalita, B., Islam, T., Patra, A., Mukherjee, A.K., 2017. Proteomic analysis to unravel the complex venom proteome of eastern India Naja naja: Correlation of venom composition with its biochemical and pharmacological properties. J Proteomics 156, 29-39.
Fatima, L., Fatah, C.J.J.o.C.T., 2014. Pathophysiological and Pharmacological Effects of Snake Venom Components: Molecular Targets. J Clin Toxicol 4, 1-9.
Georgieva, D., Seifert, J., Ohler, M., von Bergen, M., Spencer, P., Arni, R.K., et al., 2011. Pseudechis australis venomics: adaptation for a defense against microbial pathogens and recruitment of body transferrin. J Proteome Res 10, 2440-2464.
Gutierrez, J.M., Lomonte, B., Leon, G., Alape-Giron, A., Flores-Diaz, M., Sanz, L., et al., 2009. Snake venomics and antivenomics: Proteomic tools in the design and control of antivenoms for the treatment of snakebite envenoming. J Proteomics 72, 165-182.
Hamilton, M.A., Russo, R.C., Thurston, R.V., 1977. Trimmed Spearman-Karber method for estimating median lethal concentrations in toxicity bioassays. Environ Sci Technol 11, 714-719.
Harvey, A.L., 2014. Toxins and drug discovery. Toxicon 92, 193-200.
Huang, H.W., Liu, B.S., Chien, K.Y., Chiang, L.C., Huang, S.Y., Sung, W.C., et al., 2015. Cobra venom proteome and glycome determined from individual snakes of Naja atra reveal medically important dynamic range and systematic geographic variation. J Proteomics 128, 92-104.
Kazemi-Lomedasht, F., Rahimi Jamnani, F., Behdani, M., Shahbazzadeh, D., 2019. Linear mimotope analysis of Iranian cobra (Naja oxiana) snake venom using peptide displayed phage library. Toxin Rev 38, 106-114.
Kulkeaw, K., Chaicumpa, W., Sakolvaree, Y., Tongtawe, P., Tapchaisri, P., 2007. Proteome and immunome of the venom of the Thai cobra, Naja kaouthia. Toxicon 49, 1026-1041.
Laustsen, A.H., Gutierrez, J.M., Lohse, B., Rasmussen, A.R., Fernandez, J., Milbo, C., et al., 2015. Snake venomics of monocled cobra (Naja kaouthia) and investigation of human IgG response against venom toxins. Toxicon 99, 23-35.
Lomonte, B., Calvete, J.J., 2017. Strategies in 'snake venomics' aiming at an integrative view of compositional, functional, and immunological characteristics of venoms. J Venom Anim Toxins Incl Trop Dis 23, 26.
Malih, I., Ahmad rusmili, M.R., Tee, T.Y., Saile, R., Ghalim, N., Othman, I., 2014. Proteomic analysis of Moroccan cobra Naja haje legionis venom using tandem mass spectrometry. J Proteomics 96, 240-252.
Modahl, C.M., Mackessy, S.P., 2019. Venoms of Rear-Fanged Snakes: New Proteins and Novel Activities. Front.Ecol. Evol 7.
Mukherjee, A.K., 2010. Non-covalent interaction of phospholipase A (2) (PLA (2)) and kaouthiotoxin (KTX) from venom of Naja kaouthia exhibits marked synergism to potentiate their cytotoxicity on target cells. J Venom Res 1, 37-42.
Reed, L.J., Muench, H., 1938. A Simple Method of Estimating Fifty Per Cent Endpoints12. Am J Epidemiol 27, 493-497.
Sintiprungrat, K., Watcharatanyatip, K., Senevirathne, W.D., Chaisuriya, P., Chokchaichamnankit, D., Srisomsap, C., et al., 2016. A comparative study of venomics of Naja naja from India and Sri Lanka, clinical manifestations and antivenomics of an Indian polyspecific antivenom. J Proteomics 132, 131-143.
Suntravat, M., Cromer, W.E., Marquez, J., Galan, J.A., Zawieja, D.C., Davies, P., et al., 2019. The isolation and characterization of a new snake venom cysteine-rich secretory protein (svCRiSP) from the venom of the Southern Pacific rattlesnake and its effect on vascular permeability. Toxicon 165, 22-30.
Talebi Mehrdar, M., Hajihosseini, R., Madani, R., 2017. Identification and isolation of immunodominant proteins of Naja naja (Oxiana) snake venom %J Arch Razi Inst 72, 131-137.
Tan, K.Y., Tan, C.H., Chanhome, L., Tan, N.H., 2017. Comparative venom gland transcriptomics of Naja kaouthia (monocled cobra) from Malaysia and Thailand: elucidating geographical venom variation and insights into sequence novelty. Peer J 5, e3142.
Tan, K.Y., Tan, C.H., Fung, S.Y., Tan, N.H., 2015. Venomics, lethality and neutralization of Naja kaouthia (monocled cobra) venoms from three different geographical regions of Southeast Asia. J Proteomics 120, 105-125.
Vejayan, J., Shin Yee, L., Ponnudurai, G., Ambu, S., Ibrahim, I., 2010. Protein profile analysis of Malaysian snake venoms by two-dimensional gel electrophoresis. J Venom Anim Toxins Incl Trop Dis 16, 623-630.
Wong, K.Y., Tan, C.H., Tan, N.H., 2016. Venom and Purified Toxins of the Spectacled Cobra (Naja naja) from Pakistan: Insights into Toxicity and Antivenom Neutralization. Am J Trop Med Hyg 94, 1392-1399.
Yap, M.K.K., Fung, S.Y., Tan, K.Y., Tan, N.H., 2014. Proteomic characterization of venom of the medically important Southeast Asian Naja sumatrana (Equatorial spitting cobra). Acta Tropica 133, 15-25. | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,341 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 728 |
||
سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب