| تعداد نشریات | 284 |
| تعداد نشریات سازمان | 82 |
| تعداد شماره‌ها | 3,074 |
| تعداد مقالات | 34,301 |
| تعداد مشاهده مقاله | 47,134,318 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 78,041,533 |
شناسایی مولکولی و فیلوژنی گونه Gammarus komareki (Gammaridae) از رودخانه جاجرود با روش بارکدگذاری DNA | ||
| مجله علمی شیلات ایران | ||
| مقاله 6، دوره 29، شماره 3، مرداد و شهریور 1399، صفحه 57-69 اصل مقاله (884.37 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/isfj.2020.121664 | ||
| نویسندگان | ||
| سیامک یوسفی سیاه کلرودی؛ هادی یوسفی سیاهکلرودی؛ فریده چناری؛ شادی خاتمی | ||
| چکیده | ||
| گاماروسها از انواع سختپوستان ناجورپا متعلق به خانواده Gammaridae بوده که نقش و اهمیت زیادی در زنجیره غذائی، پالایش محیط از مواد آلی و حساسیت بالایی نسبت به آلودگی‌های محیطی دارند. بنابراین شناسایی آنها از اهمیت زیادی برخوردار است. از آنجاییکه شناسایی جنس گاماروس بهدلیل ویژگیهای ریختشناسی شبیه به هم بسیار مشکل میباشد؛ هدف مطالعه حاضر شناسایی دقیق مولکولی و بررسی روابط فیلوژنی گونه Gammarus komarekiاز رودخانه جاجرود در شرق استان تهران در مقایسه با سایر نقاط ایران و جهان بود. بدین منظور نمونهبرداری از گونه G. komareki رودخانه جاجرود به صورت فصلی از مهرماه 1392 تا تیرماه 1393 صورت پذیرفت. جمعآوری نمونهها توسط تور دستی کوچک انجام شد. به منظور مطالعات مولکولی مقداری بافت از هر نمونه با اسکالپل جدا و در الکل اتیلیک 95 درجه تثبیت گردید. سپس DNA نمونهها با استفاده از روش CTAB استخراج و قطعه ژنی زیر واحد یک سیتوکروم اکسیداز میتوکندری (COI) تکثیر و توالییابی شد. پس از تکثیر قطعه ژن و توالییابی آن، درختهای تبارشناسی Neighbor Joining وMaximum Likelihood با استفاده از نرمافزارهای MEGA7 ترسیم گردیدند. نتایج مطالعه حاضر نشان داد با اینکه نمونههای موردنظر از نظر ریختشناسی متعلق به گونه Gammarus komareki میباشند که از سایر مناطق ایران گزارش شده است؛ با اینحال از نظر بررسیهای ژنتیکی در کلادهای کاملاً جداگانه قرار گرفتند. بنابراین احتمال میرود متعلق به گونههای جداگانه باشند که اثبات این امر نیازمند بررسیهای دقیقتر با سایر نشانگرهای ژنتیکی میباشد. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| تنوع ژنتیکی؛ گاماروس؛ جاجرود؛ شرق تهران؛ ایران | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Molecular and phylogenic identification of Gammarus komareki species (Gammaridae) from the Jajrood River using DNA barcoding method | ||
| نویسندگان [English] | ||
| S. Yousefi Siahkalroudi؛ H. Yousefi Siahkalroudi؛ F. Chenari؛ Sh. Khatami | ||
| چکیده [English] | ||
| Gammarus (Crustacea: Amphipoda) are Gammaridae family that play an important role in food chain, environmental refining of organic matter and high sensitivity to environmental contamination. Therefore, it is important to identify them. Since the identification of the genus Gammarus is very difficult due to similar morphological features, the aim of the present study was to molecular identification and investigation of the phylogenetic relationships of G. komareki from the Jajrood River, east ofTehran compared to other parts of Iran and the rest of the world. For this purpose, sampling of G. komareki species in Jajrood River was done in season from October 2013 to July 2014. Samples were collected by a small manual tour. For molecular studies, some tissue was isolated from each sample with scalpel and fixed in 95% ethyl alcohol. The DNA of the samples was then extracted using the CTAB method and the gene fragment of a mitochondrial cytochrome oxidase (COI) subunit was amplified and sequenced. After gene fragment amplification and sequencing, Neighbor Joining and Maximum Likelihood trees were plotted using MEGA7 software. The results of the present study showed that although the specimens were morphologically belonging to Gammarus komareki species reported from other parts of Iran, however, they were completely separated in genetic clades for genetic studies. Therefore, it is likely that they belong to different species, which needs further investigation with other genetic markers. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| genetic diversity, Gammarus, Jajrood, the east of Tehran, Iran | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 406 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 274 |
||