- همه نشریات
- علوم آب و خاک
- علوم اقتصاد و ترویج کشاورزی
- علوم جنگل, مرتع و آبخیزداری
- علوم دامی و شیلات
- علوم زراعی و باغی
- علوم گیاهپزشکی
- علوم مهندسی و مکانیزاسیون کشاورزی
- مجلات ترویجی کشاورزی
- نشریات انجمن ها
- نشریات با زبان انگلیسی
- نشریات با زبان فارسی
- نشریات دانشگاه آزاد اسلامی
- نشریات علمی
- نشریات علمی سازمان تحقیقات، آموزش و ترویچ کشاورزی
آمار
| تعداد نشریات | 278 |
| تعداد نشریات سازمان | 77 |
| تعداد شماره‌ها | 2,103 |
| تعداد مقالات | 24,240 |
| تعداد مشاهده مقاله | 13,096,363 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 10,526,539 |
تجزیه و تحلیل ژنتیکی و فیلوژنتیکی بر اساس ناحیه HVR I D-loop میتوکندری سه نژاد گوسفند بومی ایران (تالشی، شال و ماکویی) | ||
| تحقیقات دامپزشکی و فرآورده‌های بیولوژیک | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 29 دی 1399 اصل مقاله (1.01 MB) | ||
| نوع مقاله: مقاله کامل | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/vj.2021.352317.1786 | ||
| نویسندگان | ||
محمود نظری   ؛ غزال محمدی اهوازی
| ||
| گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و صنایع غذایی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان، اهواز، ایران | ||
| چکیده | ||
| درصد خلوص ژنتیکی نژادهای گوسفند با توجه به تلاقی‌های کنترل نشده رو به کاهش است به همین علت حفظ تنوع زیستی در نژادهای بومی گوسفند به عنوان یک سرمایه ضرورت دارد. بنابراین هدف از انجام این پژوهش بررسی تنوع ژنتیکی و فیلوژنتیکی ناحیه HVR I D-loop ژنوم میتوکندری بین سه نژاد گوسفند تالشی، شال و ماکویی بود. جهت انجام انالیزها از توالی‌های ناحیه D-loop میتوکندری سه نژاد تالشی، شال و ماکویی ذخیره شده در بانک اطلاعاتی NCBI استفاده شد. تنوع نوکلئوتیدی برای نژاد تالشی، شال و ماکویی به ترتیب 04160/.، 04552/0 و 04422/0 و تنوع هاپلوتایپی در هر سه نژاد 00/1 برآورد شد. همچنین نتایج تجزیه واریانس مولکولی (AMOVA) حاکی از آن بود که تنوع درون جمعیت ها حدود 100 % و تنوع بین جمعیت‌ها 0% بود. این نتایج بیانگر وجود تنوع بسیار بالا در این نژادهاست. محاسبه D تاجیمای منفی برای نژاد تالشی بیان کننده این موضوع است که جمعیت نژاد تالشی بعد از گذراندن یک تنگنای ژنتیکی در حال گسترش است و انتخاب جهت دار در حال انجام است. در حالی که محاسبه D تاجیمای مثبت برای دو نژاد شال و ماکویی نشان می دهد که این دو جمعیت در حال گزینش متعادل بخش هستند. با رسم درخت فیلوژنتیک به روش NJ مشخص گردید هر سه نژاد گوسفند در گروه هاپلوتایپی D قرار دارند. از قرارگیری این نژادها در گروه نژادهای قفقاز و ترکیه میتوان نتیجه گرفت که این سه نژاد از نژادهای قدیمی گوسفند هستند و باید جهت حفظ این سرمایه‌های ملی تلاش بیشتری کرد. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| تنوع ژنتیکی؛ درخت فیلوژنتیک؛ ژنوم میتوکندری؛ گوسفند | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Genetic and phylogenetic analysis of mitochondrial D-loop HVR I region in three breeds of native sheep Iran (Taleshi, Shal and Makui) | ||
| نویسندگان [English] | ||
| M. Nazari؛ Gh Mohamadi Ahvazi | ||
| Department of Animal Science, Faculty of Animal science and Food Technology, Agricultural Science and Natural Resources University of Khuzestan, Mollasani, Ahvaz, Iran | ||
| چکیده [English] | ||
| The percentage of genetic purity of sheep breeds is declining due to uncontrolled crossbreeding, so it is essential to preserve biodiversity in the native sheep breeds that are considered a national asset. Then, aim of this study was to investigate the genetic and phylogenetic diversity of the mitochondrial HVR I region between the three Taleshi, Makui and Shal sheep. For this purpose, HVR I sequences for all three breeds were taken from the NCBI database. Nucleotide diversity for Taleshi, Shawl and Makui breeds calculated 0.0416, 0.04552 and 0.04422, respectively, and haplotype diversity in all three breeds was estimated to be 1.00. In addition, the results of molecular analysis of variance (AMOVA) showed that the diversity within populations was about %100 and in fact the total diversity was included and the diversity between populations was %0. These results indicated high genetic variation in three sheep breeds. Negative Tajima's D for Taleshi breed indicated that the this population is expanding after going through a recent bottleneck and selection sweep is in progress, while positive Tajima's D for shawl and Makui breeds demonstrated that these two populations are balancing selection. The NJ phylogenetic test results indicated that all three breeds of sheep were classified into haplotype D. From the classification of these breeds with the Caucasian and Turkish breeds in one branch, it can be concluded that these three breeds are the ancient breeds of sheep and more efforts should be made to preserve these national assets. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Genetic diversity, phylogenetic tree, mitochondrial genome, sheep | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 14 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 32 |
||
