- همه نشریات
- علوم آب و خاک
- علوم اقتصاد و ترویج کشاورزی
- علوم جنگل, مرتع و آبخیزداری
- علوم دامی و شیلات
- علوم زراعی و باغی
- علوم گیاهپزشکی
- علوم مهندسی و مکانیزاسیون کشاورزی
- مجلات ترویجی کشاورزی
- نشریات انجمن ها
- نشریات با زبان انگلیسی
- نشریات با زبان فارسی
- نشریات دانشگاه آزاد اسلامی
- نشریات علمی
- نشریات علمی سازمان تحقیقات، آموزش و ترویچ کشاورزی
آمار
| تعداد نشریات | 278 |
| تعداد نشریات سازمان | 77 |
| تعداد شماره‌ها | 2,076 |
| تعداد مقالات | 23,959 |
| تعداد مشاهده مقاله | 12,911,511 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 10,419,748 |
Investigation of phylogenetic relationships and genetic diversity of Seidlitzia rosmarinus populations by ISSR marker in some regions of Iran. | ||
| Rostaniha | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 10 تیر 1400 | ||
| نوع مقاله: Systematics and Biodiversity of Plants | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/botany.2021.351400.1213 | ||
| نویسندگان | ||
Shima Sedighi1؛ Alireza Iranbakhsh  1؛ Seyed Mehdi Hamdi2؛ Iraj Mehregan3
| ||
| 1گروه زیست شناسی، واحد علوم تحقیقات دانشگاه آزاد اسلامی، تهران،ایران | ||
| 2دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران مرکز | ||
| 3Associate Professor, Department of Biology, Science and Research Branch, Islamic Azad University, Tehran, Iran | ||
| چکیده | ||
| Genus Sedlitzia has four herbaceous species S. florida, S. cinerea, S. stokii that are herbaceous and S. rosmarinus is shrubby from family Amaranthaceae . In this research, ISSR molecular markers were used to evaluate the genetic diversity among 85 plant samples from 17 populations of S. rosmarinus. Four random primers were used to perform ISSR reactions and a total of 221 DNA bands were obtained. After forming 0 and 1 matrix with the help of GenAlex and NTSYS software was used to interpret ISSR analysis data. Molecular analysis of variance (AMOVA) was performed to estimate genetic diversity out of 85 individuals. Out of the total diversity, the highest amount of genetic diversity, 68% of which was related to intra-population diversity and 28% of inter population diversity and 4% of inter areas was calculated. MCMC analysis using Structure2.3.4 software used to investigate the genetic diversity populations of S. rosmarinus. Main coordinate analysis the method PCOA was used for extract maximum information from molecular data. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| Ashnan؛ genetic diversity؛ UPGMA method؛ cluster analysis؛ PCOA method | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| بررسی روابط فیلوژنی و تنوع ژنتیکی جمعیت های Seidlitzia rosmarinus (Amaranthaceae) با استفاده از روش ISSR در ایران | ||
| نویسندگان [English] | ||
| شیما صدیقی1؛ علیرضا ایرانبخش1؛ سیدمهدی حمدی2؛ ایرج مهرگان3 | ||
| 3دانشیار زیست شناسی و فیلوژنی مولکولی گیاهی، گروه زیست‏ شناسی، واحد علوم و تحقیقات، دانشگاه آزاد اسلامی، تهران، تهران، ایران | ||
| چکیده [English] | ||
| جنس Sedlitzia دارای چهار گونه در ایران است. گونه S. rosmarinus به شکل درختچه ای و سه گونه دیگر علفی هستند. این گونه در غرب و مرکز ایران انتشار دارد. در این تحقیق نشانگر مولکولی ISSR برای بررسی تنوع ژنتیکی 85 نمونه گیاهی از 17 جمعیت گونه S. rosmarinus جمع آوری شده، مورد استفاده قرارگرفت. در این روش از 16 پرایمر عمومی و 4 پرایمر اختصاصی استفاده شد که در مجموع 221 باند چند شکل ایجاد کردند. دندروگرام داده های ISSR مربوط به 17 جمعیت بر اساس ماتریس تشابه به روش UPGMA و ضریب تشابه Dice که از 40/0 تا 96/0 متغیر بود. آنالیز واریانس مولکولی (AMOVA) از مجموع 85 فرد به منظور برآورد تنوع ژنتیکی انجام گرفت، که از مجموع کل تنوع بیشترین میزان یعنی 68% آن مربوط به تنوع درون جمعیتی، 28% تنوع بین جمعیتی و 4% مربوط به تنوع بین مناطق بود. آنالیز MCMC با استفاده از نرم افزار Structure2.3.4 به منظور بررسی ساختار ژنتیکی در جمعیت‌های گونه اشنان مورد بررسی قرار گرفت، همچنین آنالیز مختصات اصلی به روش PCOA براساس محور مختصات اصلی اول و دوم برای نشانگر ISSR انجام شد که این روش به عنوان روش مکمل برای تجزیه خوشه‌ای با هدف استفاده بهینه از داده های مولکولی ارائه شد. با توجه به اهداف این پژوهش می توان به این نتیجه رسید که بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت های S. rosmarinus با استفاده از نشانگر ISSR مفید و روابط بین جمعیت‌ها را با وضوح بهتری نشان داده و بعضی از جمعیت ها از یکدیگر تفکیک شدند. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| اشنان, تنوع ژنتیکی, روش UPGMA, تجزیه خوشه ای, روش PCOA | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 28 |
||
