- همه نشریات
- نشریات علمی سازمان تحقیقات، آموزش و ترویچ کشاورزی
- مجلات ترویجی سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
- سایر نشریات سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
- نشریات علمی انجمن ها
- علوم آب و خاک
- علوم اقتصاد و ترویج کشاورزی
- علوم جنگل, مرتع و آبخیزداری
- علوم دامی و شیلات
- علوم زراعی و باغی
- علوم گیاهپزشکی
- علوم مهندسی و مکانیزاسیون کشاورزی
- نشریات با زبان انگلیسی
- نشریات با زبان فارسی
- نشریات دانشگاه آزاد اسلامی
- نشریات علمی
آمار
| تعداد نشریات | 281 |
| تعداد نشریات سازمان | 80 |
| تعداد شماره‌ها | 2,398 |
| تعداد مقالات | 27,798 |
| تعداد مشاهده مقاله | 15,488,389 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 12,257,523 |
مطالعه ترانسکریپتومی lncRNAها در مرغ بومی اصفهان و سویه تجاری راس | ||
| تحقیقات دامپزشکی و فرآورده‌های بیولوژیک | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 16 شهریور 1401 | ||
| نوع مقاله: مقاله کامل | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/vj.2022.358915.1982 | ||
| نویسندگان | ||
مهنوش عسکری منش1؛ جمال فیاضی  2؛ محمدتقی بیگی نصیری3؛ ایه سادات صدر4
| ||
| 1گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و صنایع غذایی، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان، ملاثانی، ایران. | ||
| 2Department of Animal Sciences, Agricultural Sciences and Natural Resources University of Khuzestan, Iran | ||
| 3گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و صنایع غذایی، دانشگاه کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان، ملاثانی، ایران | ||
| 4پژوهشکده آبزی پروری آبهای جنوب کشور، موسسه تحقیقات علوم شیلاتی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، اهواز، ایران | ||
| چکیده | ||
| به کمک روش RNA-seq می‌توان اطلاعات کاملی در خصوص شناسایی ژن‌ها بدست آورد که نتایج آن ممکن است در ژنتیک و اصلاح دام و طیور سودمند باشد. تاکنون مطالعات کمی در خصوص استفاده از این روش در ارزیابی ترانسکریپتوم طیور بومی گزارش شده است، با توجه به اهمیت lncRNAها در فرآیندهای بیولوژیکی مطالعه حاضر به بررسی lncRNAهای حاصل از ترنسکریپتوم مرغ بومی اصفهان و سویه تجاری راس 708 و تفاوت بیان آن‌ها پرداخت. در این مطالعه با استفاده از توالی‌یابی نسل جدید، 568، lncRNA شناسایی شد که تغییرات بیان 116، lncRNA معنی‌دار بود (05/0 P-value ≤). نتایج نشان داد با سطح احتمال (05/0 P-value ≤) مسیرهای بیولوژیکی مرتبط با عملکرد ژن‌های شناسایی شده متیلاسیون لایزین و هیستون، فعال‌سازی لکوسیت‌های میلوئیدی، تنظیم مثبت تولید سایتوکین، تنظیم فعال‌سازی لنفوسیت‌ها غنی می‌شوند. آنالیز عملکرد مولکولی این ژن‌ها نشان داد پروتئین تیروزین کیناز غیر غشایی، فعالیت پروتئین متیل ترانسفراز، فعالیت متیل ترانسفراز وابسته به S-آدنوزیل متیونین، انتقال گروه‌های یک کربنی و اتصال گیرنده سیگنال به طور معنی‌داری غنی می‌شوند. بر اساس نتایج حاصل، lncRNAهایی که تفاوت بیان معنی‌داری در دو گروه بومی و تجاری دارند با مسیرهای سیستم ایمنی و متیلاسیون مرتبط می‌باشند که می‌توانند به عنوان بیومارکر استفاده شوند. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| الگوی بیان ژن؛ lncRNA؛ نژاد مرغ بومی؛ سویه راس؛ RNA-seq | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Study of lncRNA transcriptome in Native-Isfahani and commercial Ross chickens | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Mahnosh Askari Manesh1؛ Jamal Fayazi2؛ Mohammad Taghi Beigi Nassiri3؛ Ayeh Sadat Sadr4 | ||
| 11- Ph.D. Student, Department of Animal Science, Animal Science and Food Technology Faculty, Agricultural Sciences and Natural Resources, University of Khuzestan, Mollasani, Iran | ||
| 2Department of Animal Sciences, Agricultural Sciences and Natural Resources University of Khuzestan, Iran | ||
| 3Department of Animal Science, Animal Science and Food Technology Faculty, Agricultural Sciences and Natural Resources University of Khuzestan, Mollasani, Iran | ||
| 4South of Iran Aquaculture Research Institute, Iranian Fisheries Science Research Institute (IFSRI), Ag-ricultural Research Education and Extension Organization (AREEO), Ahvaz, Iran | ||
| چکیده [English] | ||
| Based on the RNA-seq method. Complete information from the identification of genes can be obtained, the results of which may be useful in the genetics and breeding of livestock and poultry. So far, few studies have been reported regarding the use of this method in the evaluation of native poultry transcriptome; considering the importance of lncRNA in biological processes, the present study investigated the lncRNA from the transcriptome of Isfahan native chicken and the commercial Ras 708 strain and differential expression. In this study, 568 lncRNA were identified, which 116 lncRNA were significantly different in expression between the two groups (P-value ≤0.05). The results showed the biological process associated with these functions: Histone and lysine methylation, Myeloid leukocyte activation, Regulation of signal transduction, Positive regulation of cytokine production, and Regulation of lymphocyte activation (P-value ≤0.05). Furthermore, Non-membrane spanning tyrosine kinase activity, Protein methyltransferase activity, S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity, Transferring one-carbon groups, Acting on a protein, Signaling receptor binding was related to molecular function. Based on the results, lncRNA that vary in expression between native and commercial groups are associated with immune and methylation pathways, and can be used as biomarkers. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Gene expression pattern, lncRNA, Native chicken breed, Ross strain, RNA-seq | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 10 |
||
