اخبار و اعلانات

 آمار

تعداد نشریات284
تعداد نشریات سازمان83
تعداد شماره‌ها2,603
تعداد مقالات29,892
تعداد مشاهده مقاله18,737,705
تعداد دریافت فایل اصل مقاله14,160,763
Vahidi, Vahide, Ebrahimi, Saeideh, Akbari, Neda, Jafari, Parvaneh. (1402). Molecular identification and phylogenetic study based on the fusion gene of Newcastle disease virus (NDV) isolated from broiler poultry farms in Markazi province, Iran. سامانه مدیریت نشریات علمی, (), -. doi: 10.22092/ari.2023.362583.2756
Vahide Vahidi; Saeideh Ebrahimi; Neda Akbari; Parvaneh Jafari. "Molecular identification and phylogenetic study based on the fusion gene of Newcastle disease virus (NDV) isolated from broiler poultry farms in Markazi province, Iran". سامانه مدیریت نشریات علمی, , , 1402, -. doi: 10.22092/ari.2023.362583.2756
Vahidi, Vahide, Ebrahimi, Saeideh, Akbari, Neda, Jafari, Parvaneh. (1402). 'Molecular identification and phylogenetic study based on the fusion gene of Newcastle disease virus (NDV) isolated from broiler poultry farms in Markazi province, Iran', سامانه مدیریت نشریات علمی, (), pp. -. doi: 10.22092/ari.2023.362583.2756
Vahidi, Vahide, Ebrahimi, Saeideh, Akbari, Neda, Jafari, Parvaneh. Molecular identification and phylogenetic study based on the fusion gene of Newcastle disease virus (NDV) isolated from broiler poultry farms in Markazi province, Iran. سامانه مدیریت نشریات علمی, 1402; (): -. doi: 10.22092/ari.2023.362583.2756

Molecular identification and phylogenetic study based on the fusion gene of Newcastle disease virus (NDV) isolated from broiler poultry farms in Markazi province, Iran

Archives of Razi Institute
مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 10 تیر 1402
نوع مقاله: Original Articles
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ari.2023.362583.2756
نویسندگان
Vahide Vahidi1؛ Saeideh Ebrahimi* 2؛ Neda Akbari1؛ Parvaneh Jafari1
1Department of Microbiology, Faculty of Science, Islamic Azad University, Arak, Iran
2Central branch, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Arak, Iran
چکیده
Newcastle disease (ND) is an economically significant and extremely spreadable viral illness affecting a wide variety of avian species. ND can rapidly spread within poultry farms and result in considerable economic losses for the global poultry industry. Newcastle disease is endemic in Iran, and despite intensive vaccination efforts in the poultry industry, outbreaks of ND occur unexpectedly. This research aimed to isolate the Newcastle disease virus from poultry farms with breathing problems in the Markazi province of Iran and investigate the isolates' evolutionary relationship and molecular characteristics during 2017-2019. To this end, tissue samples (lung, brain, trachea) were taken from 42 broiler farms exhibiting respiratory symptoms. The samples were inoculated into 9-11 day-old embryonated eggs and the virus was isolated in 20 (47.6%) of the 42 farms. Subsequently, RT-PCR was used to amplify partial F gene sequences from new isolates. The amplified products were sequenced and compared phylogenetically to the standard pilot dataset (125 selected sequences) generated by the NDV consortium. As determined by phylogenetic analysis, all nine isolates belonged to sub-genotype VII.1.1 of genotype VII and were highly similar to isolates from Iran and China. All isolates possessed a polybasic cleavage site motif (112 RRQKRF117), characteristic of virulent strains. Furthermore, the present isolates shared a high nucleotide identity (96%) with viruses previously isolated from other provinces of Iran, as determined by BLAST searches and multiple alignments. In addition, they shared a high degree of sequence similarity but were distinct from existing NDV vaccines. Therefore, the genetic dissimilarity between current vaccine strains and circulating NDVs must be considered in vaccination programs.
کلیدواژه‌ها
NDV؛ genotype VII؛ chicken؛ F gene؛ phylogenetic analysis
عنوان مقاله [English]
شناسایی مولکولی و مطالعه فیلوژنتیک بر اساس ژن همجوشی ویروس بیماری نیوکاسل (NDV) جدا شده از مرغداری های گوشتی استان مرکزی، ایران
چکیده [English]
بیماری نیوکاسل (ND) یک بیماری ویروسی مهم اقتصادی و بسیار قابل سرایت است که طیف گسترده ای از گونه های پرندگان را تحت تاثیر قرار می دهد. بیماری نیوکاسل در ایران بومی است و علیرغم تلاش های فراوان واکسیناسیون در صنعت طیور، شیوع بیماری ND به طور غیرمنتظره ای رخ می دهد. این تحقیق با هدف جداسازی ویروس نیوکاسل از مرغداری‌های دارای مشکلات تنفسی در استان مرکزی و بررسی رابطه تکاملی و ویژگی‌های مولکولی جدایه‌ها طی سال‌های 1396-1398 انجام شد. برای این منظور از 42 مزرعه جوجه‌های گوشتی که علائم تنفسی داشتند، نمونه‌های بافتی (ریه، مغز، نای) گرفته شد. نمونه ها به تخم مرغ های SPF جنین دار 9-11 روزه تلقیح شدند و ویروس در 20 مزرعه (47.6%) از 42 مزرعه جدا شد. پس از آن، RT-PCR برای تکثیر توالی بخشی از ژن F جدایه های جدید استفاده شد. محصولات PCR توالی یابی شدند و از نظر فیلوژنتیکی با مجموعه داده های آزمایشی استاندارد (125 توالی انتخاب شده) تهیه شده توسط کنسرسیوم NDV مقایسه شدند. همانطور که توسط تجزیه فیلوژنتیک مشخص شد، هر 9 جدایه متعلق به زیر ژنوتیپ VII.1.1 ژنوتیپ VII بوده و شباهت زیادی به جدایه های ایران و چین داشتند. همه جدایه ها دارای یک موتیف پلی بازی (112 RRQKRF117) در محل برش بودند که مشخصه سویه های بدخیم است. علاوه بر این، مطالعات هم ترازی نشان داد که جدایه‌های حاضر شباهت نوکلئوتیدی بالایی (96%) با ویروس‌هایی که قبلاً از سایر استان‌های ایران جدا شده بودند دارند. همچنین آنها درجه بالایی از تشابه توالی را با یکدیگر داشتند اما شباهت کمتری به سویه های واکسن نیوکاسل موجود داشتند. بنابراین، تفاوت ژنتیکی بین سویه‌های واکسن فعلی و ویروس های نیوکاسل در گردش باید در برنامه‌های واکسیناسیون در نظر گرفته شود.
کلیدواژه‌ها [English]
آنالیز فیلوژنی, ویروس نیوکاسل, ژن فیوژن, ژنوتیپ VII, جوجه
آمار
تعداد مشاهده مقاله: 42


counter
سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب