- همه نشریات
- نشریات علمی سازمان تحقیقات، آموزش و ترویچ کشاورزی
- مجلات ترویجی سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
- سایر نشریات سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
- نشریات علمی انجمن ها
- علوم آب و خاک
- علوم اقتصاد و ترویج کشاورزی
- علوم جنگل, مرتع و آبخیزداری
- علوم دامی و شیلات
- علوم زراعی و باغی
- علوم گیاهپزشکی
- علوم مهندسی و مکانیزاسیون کشاورزی
- نشریات با زبان انگلیسی
- نشریات با زبان فارسی
- نشریات دانشگاه آزاد اسلامی
- نشریات علمی
پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 284 |
| تعداد نشریات سازمان | 83 |
| تعداد شماره‌ها | 2,644 |
| تعداد مقالات | 30,244 |
| تعداد مشاهده مقاله | 20,333,494 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 14,697,054 |
شناسایی ژن‌های کلیدی و مسیرهای بیولوژیکی مرتبط با کم باروری در گاو (Bos Taurus): یک مطالعه بیوانفورماتیک | ||
| تحقیقات دامپزشکی و فرآورده‌های بیولوژیک | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 03 آبان 1402 | ||
| نوع مقاله: مقاله کامل | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/vj.2023.363133.2078 | ||
| نویسندگان | ||
| علی فروهرمهر* 1؛ سید مجتبی موسوی2 | ||
| 13. گروه علوم دام، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان | ||
| 2گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد، ایران | ||
| چکیده | ||
| کم باروری یک موضوع مهم در صنعت گاوهای شیری است که می‌تواند اقتصاد یک مزرعه را تحت الشعاع قرار دهد. بنابراین، بررسی پدیده‌های بیولوژیکی که می‌تواند منجر به کم باروری شود، بسیار مهم است. مطالعه حاضر برای شناسایی ژن‌های و مسیرهای بیولوژیکی مرتبط با کم باروری طراحی شده است. به همین منظور، پروفایل بیان ژن آندومتر شامل 6 نمونه بارور و 5 نمونه نابارور گاو) (Bos Taurus از پایگاه داده GEO جمع آوری شد. ژن‌های با بیان افتراقی نمونه‌ها توسط نرم افزار آنلاین GEO2R غربالگری شدند. تجزیه و تحلیل برهمکنش پروتئین-پروتئین، تجزیه و تحلیل ماژول، تجزیه و تحلیل آنتولوژی ژن، تجزیه و تحلیل مسیرهای بیولوژیک و شناسایی ژن‌های کلیدی با بیان بیان افتراقی توسط نرم افزارهای با ارجاع دهی بالا انجام شد. بر اساس نتایج مقایسه نمونه‌های بارور و نابارور، 169 ژن به‌عنوان ژن‌های با بیان افتراقی معرفی شدند که به ترتیب حاوی 53 و 116 ژن با بیان بالا و پایین بودند. علاوه بر این، نتایج تجزیه و تحلیل ماژول وجود چهار خوشه را تایید کرد که امتیاز آنها بین 8/2 و 3 بود. نتایج تجزیه و تحلیل غنی‌سازی آنتولوژی ژن نشان داد که ترشح انتقال دهنده‌های عصبی، فضای خارج سلولی، فعالیت استروئید دهیدروژناز، چرخه وزیکول سیناپسی به ترتیب معنادارترین فرآیند بیولوژیکی، محفظه سلولی، عملکرد مولکولی و مسیر KEGG، بودند. نتایج نشان داد که 5 ژن شامل SYT1، ITGAM، HABP2، CHGA و TAT، ژن‌های کلیدی مرتبط با کم باروی هستند که می‌توانند به عنوان نشانگرهای مولکولی مناسب در برنامه‌های اصلاحی و مدیرت تولید مثل گاوداری‌ها معرفی شوند. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| کم باروری؛ ژن‌های کلیدی؛ آنالیز بیوانفورماتیکی؛ برهمکنش پروتئین-پروتئین؛ مسیرهای بیولوژیک | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Identification of Key Genes and Pathway Associated with Subfertility in Bos Taurus: a Bioinformatics Study | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Ali Forouharmehr1؛ Seyyed Mojtaba Mousavi2 | ||
| 1Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Lorestan University | ||
| 22- Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Lorestan University, Khorramabad, Iran. Email address | ||
| چکیده [English] | ||
| Subfertility is an important issue in dairy cow industry which can negatively eclipse economics of a farm. Thereby, investigation of the biological phenomena which can lead to subfertility is crucial. The current study was designed to identify hub genes and biological pathways related to subfertility. In this case, an endometrial gene expression profile including 6 fertile and 5 subfertile samples of Bos taurus was collected from database. First, up-regulated and down-regulated differentially expressed genes of the samples were screened by Geo2R server. Then, protein-protein interaction network analysis, module analysis, gene ontology enrichment analysis, pathway analysis and hub gene identification of differentially expressed genes were conducted using reliable tools and software. Based on the results of comparison between fertile and subfertile samples, 169 genes were identified as differentially expressed genes which contained 53 and 116 up-regulated and down-regulated genes, respectively. Moreover, the results of module analysis confirmed existence of four clusters which their scores were between 2.8 and 3. The results of gene ontology enrichment analysis revealed that neurotransmitter secretion, extracellular space, steroid dehydrogenase activity, synaptic vesicle cycle were the most significant terms of biological process, cellular compartment, molecular function and KEGG pathway, respectively. Finally, the results revealed that 5 genes including SYT1, ITGAM, HABP2, CHGA and TAT were hub genes which can be introduced as a proper molecular marker for breeding and management of cattle reproduction programs. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Subfertility, Hub gene, Bioinformatics analysis, Protein-protein Interaction, Biological pathways | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 67 |
||
سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب