2گروه بیوتکنولوژی، پژوهشکده فناوریهای نوین زیستی دانشگاه زنجان، دانشگاه زنجان، ایران
چکیده
مقدمه: بروسلا اُویس یک بیماری عفونی شایع در گوسفندان است که بهصورت بالینی و تحتبالینی ظاهر میشود. این پاتوژن با ایجاد ضایعات در دستگاه تناسلی، کاهش باروری، سقط جنین و افزایش مرگومیر پریناتال در برهها همراه است. اپیدیدیمیت ناشی از بروسلا اُویس باعث ایجاد تغییرات پاتولوژیک در اپیدیدیم، بیضهها و غدد جنسی جانبی میشود که منجر به اختلال در باروری قوچها میگردد. این تغییرات میتوانند استفاده از اسپرم قوچها را در لقاح آزمایشگاهی تحت تأثیر قرار داده و منجر به کاهش نرخ لقاح شوند. علاوه-بر این، کیفیت پایین اسپرم ممکن است بقای اسپرم را در فرآیندهای انجماد و ذوب مختل کند. هدف: هدف این مطالعه، تحلیل پروفایلهای بیان ژن در گوسفندان آلوده به بروسلا اُویس به منظور شناسایی ژنهای کلیدی و مسیرهای بیولوژیکی مرتبط با این عفونت است. روش کار: مجموعه دادههای مورد استفاده در این مطالعه از پایگاه داده GEO با شماره دسترسی GSE35615 استخراج شد. نمونهها از شش غده مختلف (اپیدیدیم، آمپولهای دفران، غدد وزیکولار، غدد بولبویورترال، بیضهها و مجموعهای از غدد لنفاوی شامل اینگوئینال و اسکروتال) در سه مرحله مختلف عفونت: فاز حاد (dpi 60)، فاز مزمن I ( dpi120) و فاز مزمن II (dpi 240)، و همچنین از گوسفندان سالم (dpi 0) جمعآوری شدهاند. پروفایلهای بیان ژن با استفاده از آرایه ژنومی Affymetrix Bovine انجام شده است و سطوح بیان ژنها در این شش غده در مراحل مختلف عفونت مقایسه گردید. یافتهها: از طریق تحلیلهای بیوانفورماتیکی و آماری دقیق، 45 ژن با اهمیت تنظیمی بالا شناسایی شدند که بیان تفاوتی معنیداری نشان دادند. این ژنها نقش محوری در مسیرهای اتصال مولکولی، اتصال پروتئینی، عملکرد مولکولی و مولفه سلولی ایفا میکنند. نتیجهگیری:ارائه بینشهای ارزشمندی در مورد مکانیسمهای مولکولی مرتبط با عفونت بروسلا اُویس و تأثیر آن برلقاح آزمایشگاهی. یافتههای این پژوهش اهداف بالقوهای را برای تحقیقات بیشتر در زمینه بیوتکنولوژی دامپزشکی و مدیریت سلامت تولیدمثل فراهم میکند.
Key Genes and Metabolic Pathways in Brucella ovis-Infected Sheep: Impact on Sperm Quality, In Vitro Fertilization, and Freeze-Thaw Cycles
نویسندگان [English]
Behnam Aghajan1؛ Abas Bahari2
1Department of mathematics, Faculty of science, Zanjan University, Iran,
2Department of Biotechnology, Research Institute of Modern Biological Techniques (RIMBT), Zanjan University, Iran,
چکیده [English]
Introduction: Brucella ovis is a prevalent infectious disease in sheep manifesting in clinical and subclinical forms. This pathogen causes reproductive tract lesions, reduced fertility, abortion, and increased perinatal mortality in lambs. Brucella ovis-induced epididymitis generates pathological alterations in the epididymis, testes, and accessory sex glands, leading to impaired ram fertility. These alterations may compromise the utility of ram sperm for in vitro fertilization (IVF), resulting in reduced fertilization rates. Furthermore, poor sperm quality may impair sperm survival during freeze-thaw procedures.
Objective: This study aims to analyze gene expression profiles in Brucella ovis-infected sheep to identify key genes and associated biological pathways linked to this infection.
Methods: The dataset used in this study was extracted from the GEO database (Accession Number: GSE35615). Samples were collected from six distinct glands (epididymis, vas deferens ampullae, vesicular glands, bulbourethral glands, testes, and a composite of inguinal and scrotal lymph nodes) at three infection stages: acute phase (60 dpi), chronic phase I (120 dpi), and chronic phase II (240 dpi), alongside healthy controls (0 dpi). Gene expression profiling was performed using the Affymetrix Bovine Genome Array. Comparative analysis of gene expression levels across these six glands at different infection stages was conducted.
Findings: Through rigorous bioinformatic and statistical analyses, 45 genes exhibiting significant differential expression with high regulatory significance were identified. These genes play pivotal roles in molecular binding, protein binding, molecular function, and cellular component pathways.
Conclusion: This study provides valuable insights into the molecular mechanisms underlying Brucella ovis infection and its impact on in vitro fertilization. The findings present potential targets for further research in veterinary biotechnology and reproductive health management.
کلیدواژهها [English]
Protein network, gene hub, in vitro fertilization (IVF), ontology, statistical methods
مراجع
آمار
تعداد مشاهده مقاله: 3
سامانه مدیریت نشریات علمی. طراحی و پیاده سازی از سیناوب