| تعداد نشریات | 285 |
| تعداد نشریات سازمان | 83 |
| تعداد شمارهها | 3,133 |
| تعداد مقالات | 34,832 |
| تعداد مشاهده مقاله | 50,240,578 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 86,000,576 |
Molecular characterization and phylogenetic analysis of pathogenic Leptospira based on the secY gene | ||
| Archives of Razi Institute | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 24 آذر 1404 اصل مقاله (1.48 M) | ||
| نوع مقاله: Original Articles | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/ari.2025.369930.3722 | ||
| نویسندگان | ||
| Shadi Afshar1؛ Pejvak Khaki* 1؛ Majid Esmaelizad2 | ||
| 1Department of Microbiology, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran | ||
| 2Department of Research and Development, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Agricultural Research, Education and Extension Organization (AREEO), Karaj, Iran | ||
| چکیده | ||
| Leptospirosis, caused by Leptospira spp., is a globally distributed reemerging zoonotic disease, predominantly prevalent in tropical, subtropical, temperate, and humid regions with high rainfall. Accurate identification of the causative agent is critical for effective diagnosis and disease control. This research was aimed at the genetic characterization and phylogenetic analysis of Leptospira serovars isolated in Iran by sequencing the secY gene. Twenty-seven pathogenic and two non-pathogenic Leptospira serovars were obtained from the Reference Laboratory for Leptospira, Department of Microbiology, Razi Vaccine and Serum Research Institute, Karaj, Iran. Genomic DNA was extracted, and a 549-bp fragment of the secY gene was amplified using specific primers. PCR amplification successfully identified the secY gene in all pathogenic serovars but not in the non-pathogenic L. biflexa. Sequence analysis revealed genetic similarity among pathogenic serovars ranging from 69.7% to 100%, highlighting the high discriminatory power of the secY gene. Serovars of the same serovar showed >99% sequence identity, whereas greater divergence was observed among different serovars. This gene effectively differentiated all serovars, with those belonging to the same serovar exhibiting high sequence identity (>99%), while significantly greater divergence was observed among different serovars. Phylogenetic analysis based on 26 reference serovars from established databases revealed that the majority of the studied serovars clustered with known Leptospira interrogans serovars. Additionally, two serovars were grouped with published sequences of L. borgpetersenii, L. alexanderi, L. santarosai, and L. weilii. In conclusion, the secY gene exhibited considerable variability among pathogenic Leptospira serovars, demonstrating its utility as a molecular marker for accurate identification and phylogenetic classification of Leptospira serovars. | ||
| کلیدواژهها | ||
| Leptospirosis؛ secY gene؛ molecular characterization؛ phylogenetic analysis | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| شناسایی مولکولی و آنالیز فیلوژنتیکی لپتوسپیراهای بیماریزا با استفاده از ژن secY | ||
| چکیده [English] | ||
| لپتوسپیروز یک بیماری بازپدید زئونوز است که عامل آن گونههای لپتوسپیرا میباشند و بهطور گسترده در سراسر جهان، بهویژه در نواحی گرمسیری، نیمهگرمسیری، معتدل و مرطوب با بارندگی بالا شیوع دارد. شناسایی دقیق عامل بیماریزا برای تشخیص مؤثر و کنترل بیماری بسیار ضروری است. این مطالعه با هدف شناسایی مولکولی و آنالیز فیلوژنتیکی سرووارهای لپتوسپیرا جداشده در ایران با استفاده از توالییابی ژن *secY* انجام شد. در مجموع، ۲۷ سرووار بیماریزا و ۲ سرووار غیر بیماریزای لپتوسپیرا از آزمایشگاه مرجع لپتوسپیرا در بخش میکروب شناسی مؤسسه تحقیقات واکسن و سرمسازی رازی (کرج، ایران) تهیه شدند. DNA ژنومی استخراج گردید و قطعهای به طول ۵۴۹ جفت باز از ژن *secY* با استفاده از پرایمرهای اختصاصی تکثیر شد. ژن *secY* در تمامی سرووارهای بیماریزا شناسایی شد، اما در سرووار غیر بیماریزای *L. biflexa* مشاهده نگردید. آنالیز توالی نشان داد که شباهت ژنتیکی بین سرووارهای بیماریزا از ۶۹/۷٪ تا ۱۰۰٪ متغیر است. سرووارهای مشابه بیش از ۹۹٪ شباهت توالی داشتند، در حالیکه بین سرووارهای متفاوت تفاوت های بیشتری مشاهده شد که بیانگر قدرت تفکیک بالای ژن *secY* است. آنالیز فیلوژنتیکی با استفاده از ۲۶ توالی مرجع از پایگاههای ژنی نشان داد که اکثر سرووارهای مورد مطالعه با سرووارهای شناختهشده *L. interrogans* همخانواده بودند؛ در حالیکه دو سرووار با گونههای *L. borgpetersenii*، *L. alexanderi*، *L. santarosai* و *L. weilii* گروهبندی شدند. بر اساس نتایج بهدستآمده، ژن *secY* تنوع قابلتوجهی را میان سرووارهای بیماریزای لپتوسپیرا نشان داد و بهعنوان یک نشانگر مولکولی مؤثر برای شناسایی دقیق و طبقه بندی فیلوژنتیکی این سرووارها معرفی میگردد. | ||
| کلیدواژهها [English] | ||
| لپتوسپیروز, ژن secY, شناسایی مولکولی, آنالیز فیلوژنتیکی | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 61 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 77 |
||