- همه نشریات
- نشریات علمی سازمان تحقیقات، آموزش و ترویچ کشاورزی
- مجلات ترویجی سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
- سایر نشریات سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی
- نشریات علمی انجمن ها
- علوم آب و خاک
- علوم اقتصاد و ترویج کشاورزی
- علوم جنگل, مرتع و آبخیزداری
- علوم دامی و شیلات
- علوم زراعی و باغی
- علوم گیاهپزشکی
- علوم مهندسی و مکانیزاسیون کشاورزی
- نشریات با زبان انگلیسی
- نشریات با زبان فارسی
- نشریات دانشگاه آزاد اسلامی
- نشریات علمی
آمار
| تعداد نشریات | 280 |
| تعداد نشریات سازمان | 79 |
| تعداد شماره‌ها | 2,348 |
| تعداد مقالات | 27,179 |
| تعداد مشاهده مقاله | 14,963,139 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 11,951,728 |
بررسی مسیرهای متابولیکی ژن‌های مرتبط با جایگاه صفات کمی مربوط به صفت مقاومت به انگل در ژنوم گوسفند با استفاده از رسم شبکه ژنی و هستی‌شناسی ژن | ||
| تحقیقات دامپزشکی و فرآورده‌های بیولوژیک | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 07 خرداد 1401 | ||
| نوع مقاله: مقاله کامل | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22092/vj.2022.357660.1941 | ||
| نویسندگان | ||
یاسمن زراعت پیشه1؛ سعید زره داران 1؛ علی جوادمنش  2
| ||
| 1گروه علوم دامی-دانشکده کشاورزی-دانشگاه فردوسی مشهد | ||
| 2Ferdowsi University of Mashhad | ||
| چکیده | ||
| طی دهه‌های اخیر، پیشرفت در فن‌آوری نشانگرهای مبتنی بر DNA و در دسترس بودن داده‌های ژنومی مانند جایگاه صفات کمی (QTL) و بررسی کاربرد ژن‌ها از طریق روش‌های بیوانفورماتیک نقش مهمی در درک پتانسیل ژنتیکی صفات مختلف داشته است. در این مطالعه QTL های مربوط به صفت مقاومت به انگل در گوسفند از طریق پایگاه داده AnimalQTL تهیه شد. سپس ژن‌های مربوط به هر QTL نیز از ژنوم مرجع گوسفند در پایگاه داده NCBI به دست آمد. در ادامه، به‌منظور درک ارتباط بین ژن‌های به‌دست‌آمده، شبکه‌های ژنی برای هر صفت با استفاده از نرم‌افزار Cytoscape_v3.8.0 ترسیم شد و نهایتاً به‌منظور تفسیر شبکه‌های ژنی و بررسی هستی‌شناسی ژن‌ها از نرم‌افزار Cytoscape استفاده شد. نتایج این مطالعه نشان داد درمجموع 71 QTL برای صفت مقاومت به انگل وجود دارد که تحت کنترل 198 ژن می باشند. آنالیز هستی‌شناسی در این تحقیق 20 مسیر بیولوژیکی را نشان داد که چهار مسیر سهم بیشتری داشتند و شامل: فرآیند متابولیک پیرووات، فرآوری آنتی‌ژن و عرضه آنتی‌ژن پپتید از طریق مولکول‌های اصلی سازگار بافتی کلاس I، مهاجرت سلول های عصبی و اتصال مولکول چسبندگی سلولی بودند. در این تحقیق برای اولین بار ژن‌های درگیر، هستی‌شناسی ژن‌ها، بررسی و یافتن مسیرهای متابولیکی مرتبط با صفت مقاومت به انگل در گونه گوسفند از طریق داده‌های QTL توصیف‌شد. با استفاده از روش و نتایج این تحقیق می‌توان ژن‌ها و نیز هستی‌شناسی را برای صفات مهم و اقتصادی در گوسفند و حتی سایر حیوانات اهلی مشخص و ارزیابی کرد. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| هستی‌شناسی؛ QTL؛ نشانگر؛ انگل | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Investigation of metabolic pathways of genes related to the QTL of parasite resistance trait in sheep genome using gene network and gene ontology | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Yasaman Zeraatpisheh1؛ Saeed Zerehdaran1؛ Ali Javadmanesh2 | ||
| 1Department of Animal Science-Faculty of Agriculture-Ferdowsi University of Mashhad | ||
| 2Ferdowsi University of Mashhad | ||
| چکیده [English] | ||
| In recent decades, advances in DNA-based marker technology and the availability of genomic data such as quantitative trait locus (QTL) and the study of gene utilization through bioinformatics methods have played an important role in understanding the genetic potential of different traits. In this study, QTLs related to parasite resistance in sheep were prepared through Animal QTL database. The genes for each QTL were then obtained from the sheep reference genome in the NCBI database. Next, in order to understand the relationship between the obtained genes, gene networks for each trait were drawn using Cytoscape v3.8.0 software, and finally Cytoscape software was used to interpret gene networks and study gene ontology. The results of this study showed that there were a total of 71 QTLs for the parasite resistance trait, which included 198 genes. Most of these markers were mapped using methods such as the Genome-Wide Association Study (GWAS), Regional Heritability Mapping (RHM), or Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs). Ontological analysis in this study showed 20 biological pathways that four pathways contributed more than others, including: pyruvate metabolic process, antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I, neural migration and cell adhesion molecule binding. In this study, the ontology of genes was investigated and the metabolic pathways associated with the parasite resistance trait in sheep were obtained through QTLs. Regarding methods and result of the current study, genes and gene ontology associated with other economic traits in sheep a well as other livestock species could be determined. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| Ontology, QTL, Marker, Parasite | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 17 |
||
